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细胞子刊:中国团队发现新蝙蝠冠状病毒,力证

来源:海博视频 编辑:福建新闻联播 2020-05-14 19:19 浏览次数:
SARS-CoV-2的特征之一即为在S1和S2的交界处有一个四氨基酸的插入,这种被称为弗林蛋白酶剪切位点的插入是SARS-CoV-2独有的。研究团队此番在RmYN02中S1和S2交界处也发现插入了三个残基PAA, “虽然SARS-CoV-2插入的残基(以及由此产生的核苷酸)与RmYN02中的残基不同,但可以表明它们是一个独立的插入事件,它们在野生动物(蝙蝠)中出现强烈表明它们是自然起源的,可能是通过重组获得的。”
最新的一项研究显示,去年在云南勐腊县获得的蝙蝠样本中发现一种新冠状病毒,该病毒在最长编码基因区1ab与新冠病毒(SARS-CoV-2)一致性达到97.2%。同时,研究团队在这一新冠状病毒中S蛋白(刺突糖蛋白)S1和S2交界处也发现插入了三个残基PAA,他们由此认为SARS-CoV-2在S1和S2的交界处的四氨基酸插入并非“人工痕迹”,有力证明了其起源于自然。
 
当地时间5月10日,《细胞》(Cell)旗下子刊《现代生物学》(Current Biology)在线发表了“A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein ”,来自山东第一医科大学、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室、中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院北京生命科学研究所、中国科学院武汉病毒研究所、中国科学院微生物研究所、澳大利亚悉尼大学联合团队的研究人员给出了上述结论。
 
 
在这篇论文中,研究团队报告了一种新的蝙蝠来源冠状病毒,命名为RmYN02,是在2019年5月至10月期间从中国云南省收集的227只蝙蝠的基因组分析中鉴定出来的。
 
研究显示,RmYN02和新型冠状病毒SARS-CoV-2在全病毒基因组中的同源性为93.3%,在与SARS-CoV-2最接近的1ab基因中的同源性为97.2%。相比之下,RmYN02受体结合域(RBD)与SARS-CoV-2之间呈现低序列同源性(61.3%),可能不与血管紧张素转换酶2(ACE2)结合。
 
然而,与SARS-CoV-2相似,RmYN02的特点是在S蛋白的S1和S2亚单位的剪切位点处有多个氨基酸插入。研究团队认为,这就有力证明了这种插入事件在自然界中是可以发生的。
 
这些数据表明,SARS-CoV-2源于蝙蝠和其他野生动物中存在的病毒之间的多重自然重组。
 
该论文通讯作者为山东第一医科大学基础医学院病原生物学研究所所长、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室主任史卫峰,中国科学院微生物研究所病毒传播预警与致病机制研究组组长、项目研究员毕玉海,中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心景观生态组组长、副教授Alice Catherine Hughes。该研究此前于当地时间3月5日发表在预印本网站bioRxiv上。
 
新冠病毒起源尚不明确,野生动物中仍有大量冠状病毒
 
SARS-CoV-2在中国及其他地区造成了前所未有的肺炎流行,已引起全球范围的公共卫生关注。尽管蝙蝠被认为是SARS-CoV-2 最有可能的自然宿主,但病毒的起源仍不清楚。
 
系统发育分析表明,SARS-CoV-2是一种不同于SARS-CoV和MERS-CoV的新型冠状病毒。到目前为止,与SARS-CoV-2最密切相关的病毒是RaTG13,它是中科院武汉病毒所石正丽团队于2013年在云南采集的一只中华菊头蝠标本中分离发现。RaTG13病毒株和新冠病毒具有96.1%的核苷酸同源性、92.9%的S基因同源性。这些数据再次说明蝙蝠是冠状病毒的重要宿主。
 
然而,值得注意的是,香港大学公共卫生学院新发传染病国家重点实验室管轶教授、广西医科大学胡艳玲教授团队,以及华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义教授、肖立华教授团队两个研究小组此前均报告了存在于马来穿山甲的SARS-CoV-2相关冠状病毒,这些穿山甲通过非法走私进入广西和广东。
 
研究团队提到,尽管在全基因组水平上,这些穿山甲中检测到的冠状病毒与SARS-CoV-2的距离要远于RaTG13与SARS-CoV-2的距离,但它们在S蛋白的受体结合域(RBD)上与SARS-CoV-2非常相似。
 
因此,尽管目前还不清楚穿山甲是否是SARS-CoV-2传播到人过程中的中间宿主,但它们可能在冠状病毒的生态学和进化中发挥重要作用。
 
他们认为,这些在穿山甲中发现的病毒可以表明,在野生动物中仍有大量的冠状病毒样本,其中一些可能直接参与了SARS-CoV-2的出现。
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